Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT28Q7Z3Y7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms