Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE3BQ7Z3V4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE3BQ7Z3V4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE3BQ7Z3V4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE3BQ7Z3V4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3BQ7Z3V4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3BQ7Z3V4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3BQ7Z3V4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3BQ7Z3V4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3BQ7Z3V4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3BQ7Z3V4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3BQ7Z3V4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3BQ7Z3V4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3BQ7Z3V4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE3BQ7Z3V4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms