Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNDC1Q76NI1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms