Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VSTM1Q6UX27 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VSTM1Q6UX27 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VSTM1Q6UX27 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VSTM1Q6UX27 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VSTM1Q6UX27 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VSTM1Q6UX27 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VSTM1Q6UX27 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VSTM1Q6UX27 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VSTM1Q6UX27 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VSTM1Q6UX27 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VSTM1Q6UX27 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VSTM1Q6UX27 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VSTM1Q6UX27 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VSTM1Q6UX27 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VSTM1Q6UX27 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VSTM1Q6UX27 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSTM1Q6UX27 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms