Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms