Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED9Q6R2W3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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