Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD54Q6NXT1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms