Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HES3Q5TGS1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms