Protein–RNA interactions for Protein: Q5QJU3

ACER2, Alkaline ceramidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER2Q5QJU3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACER2Q5QJU3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACER2Q5QJU3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms