Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms