Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms