Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms