Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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