Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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PTPRNQ16849 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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PTPRNQ16849 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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PTPRNQ16849 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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PTPRNQ16849 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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PTPRNQ16849 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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PTPRNQ16849 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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PTPRNQ16849 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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PTPRNQ16849 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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PTPRNQ16849 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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PTPRNQ16849 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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