Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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SGCBQ16585 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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