Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
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PCSK7Q16549 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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PCSK7Q16549 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCSK7Q16549 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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PCSK7Q16549 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
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PCSK7Q16549 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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PCSK7Q16549 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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PCSK7Q16549 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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