Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PMCHL1Q16048 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms