Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCEA2Q15560 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms