Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRKQ15262 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRKQ15262 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
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