Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAM2Q15035 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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