Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NCAPHQ15003 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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