Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
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