Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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