Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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CAPSQ13938 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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CAPSQ13938 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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CAPSQ13938 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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CAPSQ13938 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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