Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SHROOM2Q13796 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
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SHROOM2Q13796 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
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SHROOM2Q13796 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
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SHROOM2Q13796 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
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SHROOM2Q13796 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SHROOM2Q13796 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
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