Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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