Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FOXE3Q13461 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FOXE3Q13461 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FOXE3Q13461 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FOXE3Q13461 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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