Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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