Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
XRCC4Q13426 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
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