Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms