Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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SCGB2A2Q13296 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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SCGB2A2Q13296 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SCGB2A2Q13296 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SCGB2A2Q13296 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SCGB2A2Q13296 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SCGB2A2Q13296 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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SCGB2A2Q13296 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SCGB2A2Q13296 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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