Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms