Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNIP1Q12981 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms