Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARHGEF5Q12774 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF5Q12774 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms