Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf54Q08AI8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms