Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLFN5Q08AF3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms