Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms