Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms