Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms