Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREMQ03060 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREMQ03060 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREMQ03060 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREMQ03060 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CREMQ03060 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms