Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms