Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms