Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POU5F1Q01860 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POU5F1Q01860 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms