Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK16Q00536 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms