Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF5P84085 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF5P84085 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF5P84085 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF5P84085 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF5P84085 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF5P84085 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF5P84085 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF5P84085 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF5P84085 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF5P84085 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF5P84085 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF5P84085 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF5P84085 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF5P84085 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF5P84085 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF5P84085 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF5P84085 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARF5P84085 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF5P84085 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF5P84085 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF5P84085 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF5P84085 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF5P84085 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF5P84085 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF5P84085 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF5P84085 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF5P84085 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF5P84085 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF5P84085 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF5P84085 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF5P84085 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF5P84085 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF5P84085 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms