Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB1P82279 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB1P82279 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB1P82279 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB1P82279 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB1P82279 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB1P82279 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB1P82279 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB1P82279 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB1P82279 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB1P82279 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB1P82279 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB1P82279 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB1P82279 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB1P82279 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB1P82279 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB1P82279 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB1P82279 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB1P82279 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB1P82279 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB1P82279 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB1P82279 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB1P82279 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB1P82279 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB1P82279 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRB1P82279 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRB1P82279 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRB1P82279 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRB1P82279 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRB1P82279 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRB1P82279 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRB1P82279 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRB1P82279 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRB1P82279 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRB1P82279 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRB1P82279 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRB1P82279 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms