Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms