Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-21P61565 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-21P61565 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms