Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2FP61218 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2FP61218 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms