Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP6P59044 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP6P59044 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP6P59044 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP6P59044 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP6P59044 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP6P59044 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP6P59044 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP6P59044 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP6P59044 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP6P59044 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP6P59044 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP6P59044 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP6P59044 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms